La distinzione del sesso nei canarini non è sempre facile, specialmente per chi è alle prime esperienze.
Il periodo migliore per poter distinguere con più facilità il sesso dei canarini è quello riproduttivo, perchè le differenze anatomiche in questo periodo sono maggiormente evidenziate, dato che gli organi riproduttivi sono più sollecitati.
La femmina presenta la zona intorno alla cloaca più tondeggiante e gonfia, mentre il maschio in quella zona appare più turgido e con le piume leggermente più lunghe.
Se grazie a queste differenze anatomiche non si riesce ad identificare il sesso degli esemplari, non ci resta che tentare di individuarlo attraverso le attività canore proprie dei maschi.
I canarini maschi sono gli unici ad emettere un vero e proprio canto melodioso, anche nel periodo invernale durante le giornate soleggiate è possibile vederli impegnati a gareggiare tra loro, mentre le femmine emettono un semplice cinguettio.